镜鲤眼径及眼间距性状显著相关的微卫星标记筛选

• 作者: 孙效文 张明昭 徐浩 李超 程磊 邱高峰 顾颖 鲁翠云
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 农学
• 关键词: 镜鲤 眼径 眼间距 微卫星标记
• 年，卷（期）: 2013,（3）
• 页码范围: 490-498
• 分类号: S917
• 字数: 5757字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1118.2013.00490

摘要

利用镜鲤(Cyprinus carpio L.)全同胞家系68个个体,分析其眼径(ED)和眼间距(EC)与164个细菌人工染色体文库(bacterial artificial chromosome, BAC)末端序列来源的微卫星标记的相关性.结果164个微卫星标记共检测到401个等位基因,463种基因型,利用GLM模型对每个标记与对应的性状做回归分析, Permutation 10000次检验结果显示,共22个微卫星标记分别与眼径和眼间距具有显著相关性(P<0.05),其中CAFS1526等6个标记仅与眼径具有显著相关性(P<0.05), CAFS0882等11个标记仅与眼间距显著相关(P<0.05),而CAFS1298等5个标记与两个性状均具有显著相关性(P<0.05), CAFS1298和 CAFS1423与2个性状的相关性均达到极显著水平(P<0.01).用SPSS13.0的Duncan’s多重比较找到了每个标记与性状显著相关的基因型,进一步将与眼径和眼间距显著相关的标记整合到遗传连锁图谱上,其中9个微卫星标记与眼径或眼间距的 QTL 定位结果一致,其可解释表型变异率在13.3%~20.9%.