中国龙虾Pan s 1抗原表位研究及相关虾蟹类蛋白进化分析

• 作者: 何颖 邹泽红 陈惠芳 陶爱林 黄于艺
• 来源期刊: 现代仪器与医疗
• 关键词: 中国龙虾 Pan s 1 抗原表位 进化分析
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1-4
• 页数: 4页
• 分类号: R593|S986.2|Q816
• 语种: 中文

摘要

在Uniprot数据库中获得中国龙虾过敏原Pan s1蛋白序列,使用DNAStar 和NetMHC Ⅱ分别预测B细胞和T细胞表位,并对其进行抗原性评分;使用SwissModel软件生成其三维结构,并利用Ramachandran plot分析进行模型有效性评估.在Uniprot数据库搜集不同种类的虾蟹原肌球蛋白序列,利用MEGA5.1用JTT+G模型构建ML(Maximum Likelihood)进化树.结果显示,中国龙虾过敏原Pans 1三维结构为2条相互缠绕的α-螺旋.Pans 1的B/T细胞共有抗原表位区域为81～95,146～157.同体型大小的虾蟹类之间,可能更为容易产生种群间的交叉过敏反应.