浙江省近年甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶基因序列分析

• 作者: 严菊英 卢亦愚 周敏 张严峻 李榛 茅海燕 陈寅
• 来源期刊: 疾病监测
• 学科: 医学
• 关键词: 甲型H1N1流感病毒 神经氨酸酶 序列分析 种系发生树
• 年，卷（期）: 2013,（10）
• 所属期刊栏目: 传染病监测
• 页码范围: 811-814
• 分类号: R511.7
• 语种: 中文
• DOI: 10.3784/j.issn.1003-9961.2013.10.007

摘要

目的 分析浙江省2009-2013年初甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶基因(NA)序列进化特征.方法 提取浙江省2009-2013年初29株甲型H1N1流感病毒基因组RNA,反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增NA基因,测序并拼接出ORF.以浙江省不同年份与地域15份代表性毒株NA序列和GenBank数据库中选取的22株2009-2012年国内外甲型H1N1流感病毒NA基因序列,采用MEGA 5.1软件对其进行序列比对并构建种系发生树.结果 扩增并测序获得29株甲型H1N1流感病毒的NA基因ORF的全长序列,与国内外甲型H1N1流感病毒NA序列比对后显示序列的同源性较高,浙江省毒株与北美早期甲型H1N1流感病毒典型代表株A/California/04/2009(H1N1)的同源性为98.20％ ～99.50％,其中采集于2012年末和2013年初的4份病毒NA与A/California/04/2009(H1N1)的同源性为98.63％ ～99.14％.在1株采集于2010年1月的甲型H1N1流感病毒NA的基因序列中发现可导致奥司他韦耐药的H275Y突变基因型.结论 虽然浙江省后期的甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶基因累积了更多的变异,但所有毒株之间基因同源性仍然较高,所有毒株的神经氨酸酶基因同源性达到98.20％及以上,序列分析结果证实1份毒株携带奥司他韦耐药基因型突变.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	卢亦愚		127	1020	16.0	23.0
2	严菊英		97	823	16.0	22.0
3	张严峻		64	683	13.0	24.0
4	茅海燕		55	377	11.0	16.0
5	周敏		31	323	11.0	16.0
6	陈寅		21	106	6.0	9.0
7	李榛		11	70	6.0	8.0