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转mapk双链RNA干扰表达载体黄瓜对根际土壤细菌多样性的影响
转mapk双链RNA干扰表达载体黄瓜对根际土壤细菌多样性的影响
作者:
弭宝彬
李春月
李莹
陈国华
原文服务方:
生态学报
土壤细菌
16S rRNA
克隆文库
转基因黄瓜
摘要:
随着RNA干扰技术的发展,通过植物表达病原物特异的dsRNA来防治植物病害的转基因作物越来越多.转根结线虫mapk双链RNA表达载体的黄瓜能够通过RNA干扰作用沉默线虫的mapk基因,对根结线虫具有良好的防治效果.为了评价该转基因黄瓜的安全性,明确mapk双链RNA干扰表达载体转基因黄瓜植株对根际土壤细菌多样性的影响,采用16S rRNA基因克隆文库方法对非转基因黄瓜和转基因黄瓜土壤细菌群落多样性进行分析.结果表明,非转基因黄瓜土壤细菌文库包含124个OTU(可操作分类单元),转基因黄瓜土壤细菌文库包含122个OTU.2个文库共同拥有的OTU为115个.2个文库都包含1 3个类群细菌,Acidobacteria、Actinobacteria、Armatimonadetes、Bacteroidetes、candidate division BRC1、Chloroflexi、Firmicutes、Gemmatimonadetes、Nitrospira、Planctomycetes、Proteobacteria、Verrucomicrobia、unclassified_Bacteria. 其中 Proteobacteria、Bacteroidetes 、Chloroflexi和Acidobacteria是优势菌群.其他细菌类群数量相对较少.在纲分类水平上,两个文库包含的细菌类群一致,且各类群细菌比例差异不大.在Acidobacteria门中,Acidobacteria_Gp6为优势菌群.在Bacteroidetes门中,Sphingobacteria纲细菌数量最多.在Chloroflexi门中,unclassified Chloroflexi细菌最多.在Proteobacteria门中,其中Betaproteobacteria纲的细菌数量最多.从多样性指数角度分析,两种土壤细菌群落的Shannon、Simpson和Chao值差异不大.总体来看,两种土壤细菌类群差异不显著,转基因黄瓜未对根际土壤细菌群落产生明显影响.
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篇名
转mapk双链RNA干扰表达载体黄瓜对根际土壤细菌多样性的影响
来源期刊
生态学报
学科
关键词
土壤细菌
16S rRNA
克隆文库
转基因黄瓜
年,卷(期)
2013,(4)
所属期刊栏目
个体与基础生态
研究方向
页码范围
1091-1097
页数
7页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.5846/stxb201208141141
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
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1
陈国华
中国农业科学院蔬菜花卉研究所
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李莹
北华大学林学院
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弭宝彬
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李春月
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生态学报
主办单位:
中国生态学学会
出版周期:
半月刊
ISSN:
1000-0933
CN:
11-2031/Q
开本:
16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1981-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
14991
总下载数(次)
0
总被引数(次)
516896
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