两种SNP分型方法的比较及其在柚品种鉴定中的应用

• 作者: 吴波 周碧容 姜波 曾培 曾继吾 李翀 杨润婷 钟云 钟广炎
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 柚 单核苷酸多态性 等位基因特异性PCR 高分辨率熔解曲线分析 基因分型
• 年，卷（期）: 2013,（6）
• 所属期刊栏目: 果树
• 页码范围: 1061-1070
• 分类号: S666
• 语种: 中文

摘要

用两种常用的SNP分型方法,等位基因特异性PCR法(Allele-specific PCR,AS-PCR)和高分辨率熔解曲线分析(High resolution melting analysis,HRMA),对16个柚栽培品种和8个柚杂种后代材料进行了7个SNP位点的分型研究.结果表明这两种方法所得的分型结果相同,都将24个样本分成了22种基因型.值得一提的是,样本‘八朔’与‘红八朔’,‘红甘夏’与‘川野夏橙’之间在所测位点无差别,表明其应当是同一来源的无性系变异.‘早熟真龙柚’和‘中熟真龙柚’的分型结果表明它们的基因型不同,看来并非是起源同一基因型的不同芽变品种,也不存在亲子关系.可见,AS-PCR和HRMA均适用于柚类品种的区分和鉴定.AS-PCR法是一种准确、低成本的SNP分型方法,适合普通实验室使用,惟对PCR反应体系要求严格.HRMA分型法具有准确、快速、简便、分析量大的特点,但需要专门的设备,试剂成本也高.