2009年北京市甲型H1N1流行性感冒轻重症患者病毒全基因组特性分析

• 作者: 卢桂兰 崔淑娟 王全意 石伟先 邓瑛 钱海坤 黄芳
• 来源期刊: 中华预防医学杂志
• 关键词: 流感病毒A型,H1N1亚型 基因 遗传变异
• 年，卷（期）: 2013,（5）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 420-426
• 页数: 7页
• 字数: 4066字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0253-9624.2013.05.009

摘要

目的 了解北京市甲型H1N1流行性感冒(简称流感)轻症与重症患者流感病毒的全基因组特性.方法 选取北京市甲型H1N1流感检测网络实验室于2009年6-12月在北京市定点医院采集的流感病例咽拭子标本作为研究对象,共21份,包括重症病例标本10份(其中有4份标本来源于死亡病例),轻症病例标本11份.由咽拭子标本中提取病毒核酸,设计基因组全长扩增引物,病毒核酸逆转录后进行PCR,对PCR产物测序,通过序列分析软件,分析病毒各基因进化和氨基酸变异情况.结果 2009年北京市流行的甲型H1N1流感病毒8个基因节段与疫苗株A/California/07/2009(H1N1)相比,核苷酸同源性高达99％以上,未发生较大变异,其中,血凝素蛋白(HA)、神经氨酸酶(NA)、核蛋白(NP)基因的遗传距离相对较长,分别为0.0050,0.0040,0.0040; HA基因的P83S、I321V,NA基因的N248D,多聚酶(PA)基因的P224S,NP基因的V100I、L122Q变异在所有样本中均发生.重症病例的HA、NA、NP、PA、多聚酶(PB2)、非结构蛋白(NS)基因具有明显基因进化聚集性；HA基因的S128P和S203T、PA基因的R269K和D547E、PB2基因的T588I、NS基因的I123V变异主要发生在重症病例中,分别有6、9、6、7、9、6例；其中HA基因的S203T、PA基因的R269K及D547E变异与重症病例的相关性具有统计学意义(P＜0.05).HA基冈变异主要分布在Ca与Cb抗原决定簇上,NA基因上无耐药突变,膜蛋白(M2)基因均发生耐药性突变,其余毒力相关基因未见突变.结论 2009年北京市甲型H1N1流感病毒与疫苗株A/California/07/2009(H1N1)同源性较高,发现与重症及死亡病例相关的突变位点,未发现毒力基因突变.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王全意	北京市疾病预防控制中心传染病地方病控制所	250	1904	20.0	29.0
2	石伟先	北京市疾病预防控制中心传染病地方病控制所	42	279	8.0	15.0
3	黄芳	北京市疾病预防控制中心传染病地方病控制所	66	391	10.0	17.0
4	卢桂兰	北京市疾病预防控制中心传染病地方病控制所	20	57	4.0	6.0
5	邓瑛	北京市疾病预防控制中心传染病地方病控制所	35	422	12.0	19.0
6	崔淑娟	北京市疾病预防控制中心传染病地方病控制所	24	129	6.0	11.0
7	钱海坤	北京市疾病预防控制中心传染病地方病控制所	23	249	9.0	15.0