我国不同流行区利什曼原虫分离株动基体小环DNA序列分析

• 作者: 丁丹 张松 杨玥涛 汪俊云 高春花
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 中国 利什曼原虫 动基体小环DNA 序列分析
• 年，卷（期）: 2013,（11）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1055-1059,1063
• 页数: 6页
• 分类号: R382
• 字数: 3748字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/cjz.j.issn.1002-2694.2013.11.004

摘要

目的 分析我国不同流行区利什曼原虫动基体小环DNA序列差异性.方法 应用来自小环DNA保守区的一对引物KP1-KP2扩增该利什曼原虫动基体小环DNA,将扩增产物克隆于pGEM-T载体,随机选取5个阳性克隆进行双向测序,对获得的小环序列应用DNAStar软件进行比对分析,并利用Mega5.0构建系统进化树.结果 应用KP1-KP2引物分别从来自我国不同流行区利什曼原虫虫株SC、KXG-Xu、KXG-65、JIASHI-1和801扩增出单一小环序列,长度分别为858 bp,858 bp,858 bp,750 bp和748 bp.SC、KXG-Xu和KXG-65间序列一致性超过99%,JIASHI-1和801虫株序列均与其它虫株显示高度异质性.进化分析显示801与一杜氏利什曼原虫聚为一类,JIASHI-1与亲内脏的利什曼原虫聚为一大类,而SC、KXG-Xu和KXG-65三者聚为独自一类,和亲皮肤的利什曼原虫相比,与亲内脏的利什曼原虫有更近的亲缘关系.结论 我国不同流行区利什曼原虫虫株小环序列存在较大差异性.