三亚湾壮实鹿角珊瑚组织内共附生固氮菌多样性分析

• 作者: 凌娟 张偲 张燕英 潘虎 董俊德 陈蕾 龙丽娟
• 来源期刊: 科学通报
• 关键词: 壮实鹿角珊瑚 固氮菌 固氮酶基因nifH PCR-RFLP 多样性
• 年，卷（期）: 2013,（17）
• 所属期刊栏目: 海洋科学
• 页码范围: 1596-1603
• 页数: 8页
• 语种: 中文
• DOI: 10.1360/972012-51

摘要

以海南省三亚鹿回头珊瑚礁自然保护区中一种常见的壮实鹿角珊瑚(Acropora robusta)为研究对象,用PCR-RFLP方法研究其组织内共附生固氮微生物固氮酶nifH基因的多样性;用TaqⅠ和HinfⅠ这两种限制性内切酶对所获得的196个阳性克隆子进行RFLP分析,得到24个不同的OTUs (operational taxonomic units),文库覆盖率为87.65％.利用ClustalW与Mega软件对nifH基因构建的系统进化树聚成了3大类:变形菌门(Prote obacte ria)、厚壁菌门(Firmicutes)和绿菌门(Choloria),大部分的文库序列(70.83％)与变形菌门的α亚簇和β亚簇具有较高的相似性,其中α-变形菌簇占66.67％,是本文库中的优势种;次优势类群为厚壁菌门,占整个文库OTUs的16.67％;绿菌门仅占12.5％.此外,在这株珊瑚样本中获得的24个克隆子中有13条nifH基因序列与它们最相近序列的相似性小于97％.综上结果表明该壮实鹿角珊瑚组织内的共生固氮菌的具有较高的多样性,而且还可能含有大量未被培养的新的固氮基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈蕾	中国科学院南海海洋研究所	29	178	8.0	12.0
2	张偲	中国科学院南海海洋研究所	63	709	14.0	23.0
3	龙丽娟	中国科学院南海海洋研究所	26	214	7.0	14.0
4	董俊德	中国科学院南海海洋研究所	11	158	4.0	11.0
5	潘虎	中国科学院南海海洋研究所	3	28	1.0	3.0
6	张燕英	中国科学院南海海洋研究所	5	9	1.0	3.0
7	凌娟	中国科学院南海海洋研究所	7	18	3.0	4.0