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利用TaqMan-MGB探针检测A(H3N2)亚型流行性感冒病毒E119V耐药突变
利用TaqMan-MGB探针检测A(H3N2)亚型流行性感冒病毒E119V耐药突变
作者:
成艳辉
李希妍
王钊
肖宁
蓝雨
谭敏菊
赵翔
隗合江
黄维娟
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
流感病毒A型,H3N2亚型
突变
逆转录聚合酶链反应
核酸探针
摘要:
目的 建立快速检测A(H3N2)亚型流行性感冒病毒(简称流感病毒)神经氨酸酶(M)基冈E119V奥司他韦耐药突变位点的双重实时荧光定量逆转录PCR(rRT-PCR)方法.方法 由GenBank获取2000-2012年A(H3N2)亚型流感病毒NA基因序列26条,据此设计特异性靶向NA E119V突变位点的TaqMan-MGB探针进行双重rRT-PCR反应,并利用耐药参考株、临床分离株进行敏感性、特异性和重复性评价.结果 建立了快速检测NA基因E119V位点的双重rRT-PCR检测方法.本方法在A(H3N2)病毒(HA=8)稀释度至10-5仍可检测到荧光信号,病毒滴度的对数与Ct值之间呈线性相关,具有较高的灵敏度;与无耐药突变的A(H3N2)流感病毒及其他呼吸道病毒均无交叉反应,两条TaqMan-MGB探针之问不存在交叉反应,具有很高的特异性,并能够检测耐药株和敏感株混合病毒中的耐药突变,在较高浓度的混合病毒中对耐药突变的检测限是5%,在低浓度混合病毒中的检测限是50%.重复性试验得到H3N2-119E和H3N2-119V两组探针批内平均变异系数(CV)值分别为2.32%和0.57%,批间CV值分别为1.77%和0.97%,具有较好的重复性.对其中20株病毒的NA基因序列进行分析,证实这些毒株的NA基因119位点均为谷氨酸(E),表明本研究设计的方法与序列测定结果一致.结论 建立了基于TaqMan-MGB探针检测A(H3N2)亚型流感病毒E119V耐药突变的双重rRT-PCR方法,该方法灵敏、特异、重复性好,实验过程和结果判读简单易操作.
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文献信息
篇名
利用TaqMan-MGB探针检测A(H3N2)亚型流行性感冒病毒E119V耐药突变
来源期刊
中华预防医学杂志
学科
关键词
流感病毒A型,H3N2亚型
突变
逆转录聚合酶链反应
核酸探针
年,卷(期)
2013,(5)
所属期刊栏目
检验技术
研究方向
页码范围
448-451
页数
4页
分类号
字数
3210字
语种
中文
DOI
10.3760/cma.j.issn.0253-9624.2013.05.015
五维指标
传播情况
被引次数趋势
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引文网络
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参考文献
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研究主题发展历程
节点文献
流感病毒A型,H3N2亚型
突变
逆转录聚合酶链反应
核酸探针
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中华预防医学杂志
主办单位:
中华医学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0253-9624
CN:
11-2150/R
开本:
大16开
出版地:
北京市西城区宣武门东河沿街69号
邮发代号:
2-61
创刊时间:
1953
语种:
chi
出版文献量(篇)
6283
总下载数(次)
26
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