番茄SlAGO7基因的克隆及表达分析

• 作者: 先志强 向娅 李正国 林冬波
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 番茄 SlAGO7 基因克隆 表达分析
• 年，卷（期）: 2013,（4）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 641-647
• 页数: 7页
• 分类号: S641.2|Q78
• 字数: 5120字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2013.04.011

摘要

根据番茄基因组数据库中AG07的EST序列信息,利用RACE和PCR技术从番茄花cDNA和叶基因组DNA中分别克隆S/A G07的cDNA全长序列和基因组序列,用生物信息学方法对其基因序列特征进行分析;利用Real-time PCR分析S/AG07在整个生长与发育过程中的时空表达模式.结果表明,SlAG07的cNDA全长片段为3 238 bp(GenBank登录号:JX467714),含有3 003 bp的完整开放阅读框,编码1 000个氨基酸,共包含3个外显子和2个内含子.所编码的氨基酸序列含有两个高度保守的PAZ和PIWI结构域,具有典型的AGO类蛋白的结构特征;与已报道的AGO7蛋白序列有较高的同源性;SlAG07基因属于AGO蛋白家族中ZIPPY/AG07亚族.SlAG07在营养组织叶中微弱表达,主要集中在根和茎表达；而在生殖器官花中强烈表达,表达丰度从花蕾到盛开的花呈递增趋势,但在果实不同发育时期中表达都非常微弱甚至不表达.由此推测,SlAG07蛋白可能与番茄花器官的发育相关.这为进一步研究该基因通过ta-siRNA干扰途径来调控番茄花器官发育形成的分子机制奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李正国	重庆大学生命科学学院基因工程研究中心	49	533	11.0	21.0
2	林冬波	重庆大学生命科学学院基因工程研究中心	3	12	2.0	3.0
3	先志强	重庆大学生命科学学院基因工程研究中心	4	9	1.0	3.0
4	向娅	重庆大学生命科学学院基因工程研究中心	1	9	1.0	1.0