玉树马和德保矮马SLC36A1基因多态性研究

• 作者: 党瑞华 徐苹 王风巧 雷初朝 黄洁萍
• 来源期刊: 家畜生态学报
• 学科: 农学
• 关键词: 马 SLC36A1基因 多态性 SNP PCR-RFLP
• 年，卷（期）: 2013,（7）
• 所属期刊栏目: 科学研究
• 页码范围: 15-19,24
• 页数: 6页
• 分类号: S811.6
• 字数: 3651字
• 语种: 中文

摘要

控制马香槟毛色的CH (Champagne gene)基因家族包含4个候选基因(SLC36A1、SLC36A2、SLC36A3、SPARC),研究发现SLC36A1基因外显子2的突变是造成马香槟毛色的关键位点.为揭示中国马SLC36A1基因遗传多态性,本研究以玉树马和德保矮马共74个样本为研究对象,以马DNA池为模板扩增SLC36A1基因的10个外显子及部分内含子序列并进行测序分析.共发现马SLC36A1基因5个SNPs,分别位于内含子3(g.26699953 A＞G,g.26699851G＞C,g.26699850 G＞C),外显子4(g.26699562 G＞A)及外显子6(g.26697018 C＞T).利用PCR-RFLP方法对74个家马样本进行基因分型,发现外显子6的SNP有基因型CC、CT;外显子4的SNP有基因型GG、GA;内含子3的g.26699850 G＞C突变有基因型GG、GC;内含子3的另外2个SNPs(g.26699953 A＞G,g.26699851 G＞C)通过测序,发现有AA、AG、GG与GG、GC、CC基因型.所有5个马SNPs均为野生型占主要优势.由此界定了马SLC36A1基因有9种单倍型(H1-H9),其中H5是最主要的单倍型.德保矮马遗传多样度为0.4190,比玉树马(0.2228)高,表明德保矮马香槟毛色遗传多态性比玉树马更丰富.玉树马与德保矮马的平均单倍型多样度为0.3160,表明其香槟毛色遗传多态性相对较低.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	雷初朝	西北农林科技大学动物科技学院	129	758	15.0	23.0
2	党瑞华	西北农林科技大学动物科技学院	33	72	4.0	5.0
3	徐苹	西北农林科技大学动物科技学院	5	15	2.0	3.0
4	黄洁萍	西北农林科技大学动物科技学院	6	24	3.0	4.0
5	王风巧	西北农林科技大学动物科技学院	1	2	1.0	1.0