云南甘薯病毒的检测及主要病毒的多样性分析

• 作者: LI Ru-Hui 包改丽 左瑞娟 李凡 饶维力
• 来源期刊: 微生物学通报
• 关键词: 甘薯病毒病 病原检测 复合侵染 多样性分析
• 年，卷（期）: 2013,（2）
• 所属期刊栏目: 农业微生物
• 页码范围: 236-248
• 语种: 中文

摘要

[目的]明确云南甘薯病毒的种类,并对主要病毒进行遗传多样性分析.[方法]利用PCR/RT-PCR技术,对采自云南16个县、市的279个甘薯样品进行扩增、测序,对所得序列应用分子生物学软件MEGA 5进行系统发育分析.[结果]除普洱和祥云的样品中未检测到任何病毒外,其余14个县、市的123个甘薯样品中共检测到甘薯褪绿斑病毒(SPCFV)、甘薯羽状斑驳病毒(SPFMV)、甘薯卷叶病毒(SPLCV)、甘薯C病毒(SPVC)、甘薯G病毒(SPVG)和甘薯病毒2号(SPV2)等6种病毒.其中SPVG的检出率最高,达39.1％,为云南甘薯病毒的优势种,SPFMV和SPVC的检出率分别为26.9％和24.7％,而SPLCV检出率最低,仅为0.4％.在所检测的样品中未发现甘薯褪绿矮化病毒(SPCSV)和甘薯轻斑驳病毒(SPMMV).云南甘薯病毒多数为2-5种病毒复合侵染,占总样品数的31.9％,其中2-3种病毒复合侵染现象最为常见,单一病毒侵染占总样品数的12.2％.检出率比较低的SPCFV、SPLCV和SPV2未发现单独侵染现象.[结论]云南甘薯上发生的SPFMV分离物存在EA株系和O株系,未发现RC株系,另有两个分离物同EA、O、RC之间的亲缘关系均较远,有可能是一个新的株系；SPVC和SPVG分离物均可分为3个不同的组,大部分SPVG云南分离物属于Ⅰ组.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李凡	云南农业大学农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室	63	368	10.0	15.0
2	包改丽	云南农业大学农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室	5	24	2.0	4.0
3	左瑞娟	云南农业大学农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室	4	24	3.0	4.0
4	饶维力		1	11	1.0	1.0