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摘要:
采用分子生物学的方法(定性/定量PCR、克隆文库)对洞庭湖岸边带沉积物中氨氧化古菌(Ammonia-Oxidizing Archaea,AOA)进行分子水平的多样性和丰度分析,并结合硝化速率潜势(Potential Nitrification Rate,PNR)剖析AOA在洞庭湖岸边带沉积物中氨氧化的作用.采用实时荧光定量PCR技术对氨氧化古菌AOA和氨氧化细菌(Ammonia-Oxidizing Bacteria,AOB)进行靶向amoA基因(氨氧化关键功能基因)的定量分析,发现古菌amoA基因的丰度为1.49×107 ~ 1.97×10s copies· g-1(以干土计),高于细菌amoA基因丰度(1.52×104 ~2.45×106copies·g-1,以干土计)1~4个数量级.洞庭湖岸边带沉积物硝化速率潜势为1.11 ~6.47 nmol·g-1·h-1(以N计),比细胞硝化速率为0.55 ~1.68 fmol· cell-1·d-1(以NH3计).硝化速率潜势与古菌amoA基因丰度之间呈现正向变化趋势,而与细菌amoA基因丰度呈负向变化趋势,指示了低氨氮环境下AOA在氨氧化过程中的主导作用.生物多样性分析表明,经酶切分型后得到的22个古菌amoA基因序列以97%的相似度划分为8个独立操作单元(Operational Taxonomic Unit,OTU).系统发育分析显示,OTU 1~6(14个序列)属于第一分支,OTU 7~8(8个序列)属于第二分支,且均属于一个新命名的古菌类群——奇古菌门(Thaumarchaeota).
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内容分析
关键词云
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文献信息
篇名 洞庭湖岸边带沉积物氨氧化古菌的丰度、多样性及对氨氧化的贡献
来源期刊 环境科学学报 学科 地球科学
关键词 氨氧化古菌(AOA) 多样性 丰度 岸边带沉积物
年,卷(期) 2013,(6) 所属期刊栏目 研究报告
研究方向 页码范围 1741-1747
页数 分类号 X171
字数 语种 中文
DOI
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 王衫允 中国科学院生态环境研究中心环境水质学国家重点实验室 3 100 3.0 3.0
3 祝贵兵 中国科学院生态环境研究中心环境水质学国家重点实验室 23 432 9.0 20.0
4 周磊榴 中国科学院生态环境研究中心环境水质学国家重点实验室 4 66 4.0 4.0
10 姜博 中国科学院生态环境研究中心环境水质学国家重点实验室 5 67 4.0 5.0
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研究主题发展历程
节点文献
氨氧化古菌(AOA)
多样性
丰度
岸边带沉积物
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
环境科学学报
月刊
0253-2468
11-1843/X
大16开
北京2871信箱
82-625
1981
chi
出版文献量(篇)
8260
总下载数(次)
30
总被引数(次)
181770
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
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