潜伏结核感染者CD4+T细胞miR-29家族、靶基因IFN-γ的表达及生物信息学分析

• 作者: 付玉荣 伊正君 张波 李建花
• 来源期刊: 中华预防医学杂志
• 关键词: 潜伏性结核病 计算生物学 miR-29 IFN-γ
• 年，卷（期）: 2013,（7）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 632-636
• 页数: 5页
• 字数: 3457字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/cma.j.issn.0253-9624.2013.07.012

摘要

目的 探讨潜伏结核感染和活动性肺结核感染对患者外周血CD4+T细胞内miR-29家族及其靶基因IFN-γ表达的影响.方法 于2012年3-12月,在山东省潍坊市某两家医院选取调查对象并分为3组:活动性肺结核组(30例)、潜伏结核感染(LTBI)组(25例)和健康对照组(30名).分离纯化3组受试者外周血中的CD4+T细胞；用核酸杂交与荧光定量PCR检测CD4+T细胞内miR-29a、miR-29b和miR-29c的表达；用定量PCR检测miR-29靶基因IFN-γ的表达；用TargetScan与PicTar联合预测miR-29家族的靶基因；用David数据库和Cytoscape软件对miR-29家族的预测靶基因进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)生物通路富集分析.结果 miR-29a、miR-29b和miR-29c在活动性肺结核组、LTBI组和健康对照组CD4+T细胞中的表达水平均不同(P ＜0.05):miR-29b和miR-29c在活动性肺结核组的表达(561.63±65.36,281.85±42.78)高于健康对照组(260.74±38.69,128.21±19.98),低于LTBI组(2030.29±321.68,620.93±79.14)；miR-29a在对照组的表达水平(913.95±104.73)高于活动性结核组(323.37±54.38),低于LTBI组(4782.13±567.81).靶基因IFN-γ在3组之间的表达水平亦不同(P ＜0.05):LTBI组(0.45±0.09)低于健康对照组(1.00),而高于活动性结核组(0.11±0.03).miRNA-29家族的预测靶基因的GO功能富集于细胞外基质结构成分、转录调节活性等分子功能方面；在KEGG的通路数据库中,miR-29家族预测靶基因集合显著富集于局部黏附信号通路、调节细胞骨架与mTOR信号通路等方面.结论 LTBI和活动性结核感染明显增加了患者外周血CD4+T细胞内miR-29家族的表达,降低了其靶基因IFN-γ的表达,从而影响了信号通路等生物学过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	付玉荣	潍坊医学院基础部病原生物学教研室	136	281	8.0	9.0
2	张波	潍坊医学院基础部病原生物学教研室	14	69	4.0	7.0