二穗短柄草CCCH型锌指蛋白基因家族成员的鉴定和分析

• 作者: 余沁欣 李金枝 柯世省 蒋明 陈珂珺
• 来源期刊: 麦类作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 二穗短柄草 CCCH 基因家族 鉴定
• 年，卷（期）: 2013,（5）
• 所属期刊栏目: 遗传育种
• 页码范围: 849-854
• 页数: 6页
• 分类号: S512.9|S330
• 字数: 3487字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7606/j.issn.1009-1041.2013.05.001

摘要

CCCH型锌指蛋白基因以基因家族的形式存在,在信号转导调控、形态发生和逆境应答等诸多生物学过程中起着重要作用.为给该基因的克隆及功能研究提供参考信息,本研究针对二穗短柄草的基因组序列,运用多种生物信息学方法在全基因组范围对CCCH型锌指蛋白基因进行了鉴定分析.结果表明,二穗短柄草共有61个含CCCH基序的蛋白质,它们的基因DNA序列全长825～13 288 bp,内含子数量0～13个,编码区全长498～4 944 bp,编码165～1 007个氨基酸;共检测到145个CCCH基序,以C-X8-C-X5-C-X3-H和C-X7-C-X5-C-X3-H最为常见;基因不均等地分布在5条染色体上,其中2号染色体分布最多,有21个,5号染色体分布最少,仅4个;系统发育分析表明,61个成员可分为8组.