hsa-miR-1908靶基因预测及生物信息学分析

• 作者: 倪毓辉 史春梅 夏黎 季晨博 庞玲霞 杨蕾 郭锡熔 陈玲
• 来源期刊: 临床儿科杂志
• 学科: 生物学
• 关键词: miR-1908 miRNA 生物信息学 人脂肪细胞 肥胖
• 年，卷（期）: 2013,（9）
• 所属期刊栏目: 综合报道
• 页码范围: 820-824
• 页数: 5页
• 分类号: Q344
• 字数: 2304字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-3606.2013.09.006

摘要

目的对hsa-miR-1908进行系统的生物信息学分析，预测其可能参与的生物学过程及信号通路，为深入研究其在人脂肪细胞分化、肥胖发生等过程中的功能与机制奠定基础。方法应用miRBase获取hsa-miR-1908的序列，并分析其特征；应用miRanda预测hsa-miR-1908的靶基因，并取预测结果及基因芯片结果的交集，进一步进行基因功能注释（Gene ontology）和生物通路富集分析（Pathway enrichment)。结果 hsa-miR-1908在各物种之间有一定保守性，其靶基因功能富集于Wnt受体信号的调控、细胞周期、细胞凋亡等生物学过程；其靶基因信号通路富集于促性腺激素释放激素信号通路、MAPK信号通路、胰岛素信号通路、细胞周期等信号转导通路及胰腺癌等疾病通路中。结论 hsa-miR-1908预测的靶基因集合富集于多个信号通路及生物学过程，与肥胖密切相关，为后续has-miR-1908在人脂肪细胞中生物学功能研究奠定基础。