PCBP2基因座位上长非编码RNA的筛选与鉴定

• 作者: 刘雪梅 吴朝 张靖 朱丽媛 赵阿妮 阴彬
• 来源期刊: 基础医学与临床
• 学科: 生物学
• 关键词: ESTs 生物信息学分析 long noncoding RNA 筛选 鉴定 表达谱分析
• 年，卷（期）: 2013,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 694-698
• 页数: 5页
• 分类号: Q522
• 字数: 2387字
• 语种: 中文

摘要

目的 从EST鉴定人手利用生物信息学方法筛选验证PCBP2基因内部UC.338基因座位附近的长非编码RNA.方法 首先利用生物信息学方法筛选包含内含子转录区域的ESTs,经CPC分析和统计学比较,共筛选到4个(人、鼠各两个)可能的lncRNAs,用PCR方法进行鉴定,克隆到pGEM-T载体测序验证,并用PCR,real-time PCR的方法检测各ESTs在人源细胞系或小鼠不同组织,小鼠发育不同时间点大脑中的表达谱.结果 筛选到4个ESTs中有3个ESTs均具有一定的非编码特征,并最终测序正确:1个人源,2个鼠源,并且其中有些lncRNAs具有一定的细胞、组织特异性,有些lncRNAs具有广谱表达模式.结论 使用了一种新的寻找lncRNAs的方法,从EST鉴定入手,对现有数据库进行了挖掘.找到了可能在小鼠大脑发育过程中起作用的lncRNAs.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	阴彬	中国医学科学院基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室	26	36	3.0	5.0
2	张靖	中国医学科学院基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室	10	28	3.0	4.0
3	朱丽媛	中国医学科学院基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室	5	5	1.0	1.0
4	赵阿妮	中国医学科学院基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室	1	1	1.0	1.0
5	吴朝	中国医学科学院基础医学研究所医学分子生物学国家重点实验室	1	1	1.0	1.0
6	刘雪梅	河北北方学院病理及病理生理学实验室	1	1	1.0	1.0