基于线粒体DNA分子标记的东太平洋茎柔鱼群体遗传多样性比较分析

• 作者: 余为 刘连为 王从军 许强华 闫杰 陈新军
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 茎柔鱼 遗传多样性 遗传结构 细胞色素b基因 细胞色素氧化酶Ⅰ基因
• 年，卷（期）: 2013,（11）
• 页码范围: 1618-1625
• 分类号: Q347|S917.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2013.38490

摘要

为合理开发利用东太平洋茎柔鱼资源,需要准确掌握其种群结构.基于线粒体细胞色素b(Cytb)与细胞色素氧化酶Ⅰ(COⅠ)2个分子标记对茎柔鱼赤道海域与秘鲁外海2个地理群体的遗传多样性现状进行比较分析.分析认为,基于Cytb基因所有序列得到2个群体总的单倍型数、单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数及平均核苷酸差异数分别为7、(0.397±0.079)、(0.001 09±0.000 96)和0.600,秘鲁外海群体单倍型多样性指数仅为(0.282±0.101),明显低于赤道海域群体.基于CO Ⅰ基因所有序列得到2个群体总的单倍型数、单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数及平均核苷酸差异数分别为17、(0.787±0.051)、(0.00290±0.001 38)和1.802.单倍型网络关系图及两两群体间遗传分化系数Fst分析结果显示,赤道海域群体与秘鲁外海群体不存在显著的遗传差异(Cytb:Fst=0.005 91,P＞0.05;COⅠ:Fst=0.055 23,P＞0.05),2个地理群体可能在赤道海域海流的作用下发生基因交流.单倍型网络关系图、中性检验和核苷酸不配对分析结果均表明,茎柔鱼经历过近期群体扩张事件,发生群体扩张的时间在138 900 ～167 900年前.