甘蔗割手密种和热带种基因差异表达的基因芯片和Solexa高通量技术的比较分析

• 作者: 侯平 庄南生 王英 高和琼
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甘蔗 差异表达 基因芯片 Solexa技术
• 年，卷（期）: 2013,（6）
• 所属期刊栏目: 生物技术与组织培养
• 页码范围: 1071-1075
• 页数: 5页
• 分类号: S566.1
• 字数: 4174字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2013.06.014

摘要

分别采用甘蔗表达谱芯片和Solexa技术,对甘蔗热带种和割手密种基因表达谱进行分析.结果表明:基因芯片技术筛选得到1 245个差异表达基因；Solexa技术分别在热带种和割手密种中得到42 913 194个和39 363 668个初始tag,从中获得143 121和112 281个高质量测序标签(clean tags),对应的标签种数(distinctclean tags)分别为25 164和20 349,未知序列(unknown clean tags)分别为117 957和91 932,其中差异表达基因有l 432个.基因芯片和Solexa技术得到的差异基因中有823个是相同的,主要涉及非生物刺激响应、磷代谢、转录调控等功能.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王英	海南大学热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室	48	301	9.0	15.0
2	高和琼	海南大学热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室	29	166	7.0	12.0
3	庄南生	海南大学热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室	54	449	9.0	19.0
4	侯平	海南大学热带作物种质资源保护与开发利用教育部重点实验室	2	5	1.0	2.0