猪输血传播病毒2型福建株ORF1基因特征

• 作者: 修金生 吴学敏 李涛 林群群 王斌 陈如敬
• 来源期刊: 福建农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 猪输血传播病毒 ORF1基因 特征
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 动物科学
• 页码范围: 14-17
• 页数: 4页
• 分类号: S852
• 字数: 2040字
• 语种: 中文

摘要

参照GenBank中登录的猪输血传播病毒2型(Torque Teno Virus genogroup 2,TTV2) ORF1基因序列特征设计特异性引物,采用PCR方法对从福建省某猪场采集的血液基因组DNA中扩增到猪输血传播病毒2型ORF1基因,并对目的片段进行克隆测序.结果表明,所扩增的目的片段编码有TTV2完整的ORF1基因开放阅读框,全长为1 875 bp,编码有624个氨基酸.运用生物信息学软件,将获得猪TTV2福建株ORF1基因序列和GenBank中登录的猪TTV2进行分析比较,其和FJ/China/2010/TTV2/2(GenBank登录号JF937656)的同源性高达98.8％,和四川株(GenBank登录号HQ204188)核苷酸同源性最低,仅为83.5％.从遗传进化上看,猪输血传播病毒2型可以分为3个明显的分支亚群,福建分离株在基因1群和基因2群均有分布,推测福建省存在多亚群猪TTV2流行.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林群群	福建农林大学动物科学学院	10	11	2.0	2.0
2	修金生	福建农林大学动物科学学院	33	150	7.0	11.0
3	李涛	福建农林大学动物科学学院	32	135	6.0	10.0
4	王斌	福建农林大学动物科学学院	11	116	6.0	10.0