文蛤30个微卫星标记的开发及在斧文蛤和帘文蛤中的通用性检测

• 作者: 周小龙 姚韩韩 林志华 董迎辉 齐晓艳
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 文蛤 G-SSRs EST-SSRs 多态性 通用性
• 年，卷（期）: 2013,（8）
• 页码范围: 1147-1154
• 分类号: Q178.1|S917.4
• 语种: 中文
• DOI: 10.3724/SP.J.1231.2013.38484

摘要

为开展文蛤多态性微卫星标记及其在斧文蛤和帘文蛤中的通用性研究,实验从磁珠富集法构建的基因组文库和EST文库中开发了30个文蛤多态性微卫星标记,包括8个G-SSR和22个EST-SSR多态性位点.共获得140个等位基因,平均等位基因数为4.67；多态性信息含量、观测杂合度、期望杂合度分别为0.172～0.744、0.040 ～0.720、0.187 ～0.793；G-SSRs的平均等位基因数、平均多态性信息含量、平均观测杂合度和平均期望杂合度都较EST-SSRs高；Hardy-Weinberg平衡检测发现,24个位点偏离了平衡状态；利用BLASTx对含多态性SSR位点的EST进行功能注释,11个位点来自注释基因序列.将30对文蛤多态性SSR引物分别在斧文蛤和帘文蛤中进行了通用性检测,通用率分别为40％和30％.这些微卫星多态性位点的获得,为进一步开展文蛤遗传多样性分析、种质资源评价、分子标记辅助选育等奠定了基础,并且可用于文蛤、斧文蛤和帘文蛤的比较作图、基因发掘和QTL定位等研究.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	林志华	浙江万里学院浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室	66	512	13.0	17.0
2	董迎辉	浙江万里学院浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室	39	373	12.0	16.0
3	姚韩韩	浙江万里学院浙江省水产种质资源高效利用技术研究重点实验室	22	170	9.0	12.0
4	周小龙	上海海洋大学水产与生命学院	3	26	2.0	3.0
5	齐晓艳	宁波大学海洋学院	1	23	1.0	1.0