牛科物种 FSHβ基因外显子3编码区遗传多态性及其生物信息学分析

• 作者: 哈福 李大林 杨秋丽 苗永旺 袁峰 袁跃云 霍金龙
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 农学
• 关键词: 牛科物种 促卵泡素β亚基基因 外显子3 多态性 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2013,（2）
• 页码范围: 52-59
• 页数: 8页
• 分类号: S823.8|Q75
• 字数: 6087字
• 语种: 中文

摘要

促卵泡素是动物垂体前叶分泌的重要繁殖调控激素。采用PCR产物直接测序法对河流型和沼泽型水牛、牦牛和大额牛的FSHβ基因外显子3编码区进行群体变异检测，并进行了生物信息学分析。牛科物种FSHβ基因外显子3编码区均为231 bp。在水牛中共发现16个SNP位点，其中异义替换13个，推测4个异义替换对FSH功能有显著影响（subPSEC＜-3）。沼泽型水牛中发现的SNP位点均与河流型水牛共享，但它们在两类水牛中的群体遗传组成不同。在普通牛、牦牛和大额牛中分别确定8，3，1个SNP位点，但只有SNP307是异义替换，普通牛与牦牛共享该位点，推测其对FSH功能无显著影响（subPSEC＞-3）。在山羊中有11个SNP位点，8个为异义替换，推测只有SNP253对FSH功能有显著影响（subPSEC＜-3）。在绵羊中有3个SNP位点，皆为同义替换。确定水牛特有的核苷酸位点4个，山羊特有的位点1个，普通牛、牦牛和大额牛共有的核苷酸位点4个，山羊和绵羊中共有的位点2个，这些位点编码氨基酸的差异可能引起了不同类型牛科物种间FSHβ亚基功能上的差异性。