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基于氨基酸性质的EB病毒抗原MHC-I类分子限制性表位的定量构效关系建模
基于氨基酸性质的EB病毒抗原MHC-I类分子限制性表位的定量构效关系建模
作者:
林治华
王远强
纪永军
罗鸿
胡勇
蓝君
路亚阔
韩英子
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
EB病毒
表位
平衡解离常数
构效关系
肿瘤
摘要:
目的 建立EB病毒(EBBV)抗原表位的理论计算模型并用于其定量预测,为肿瘤免疫的多肽疫苗设计提供理论基础.方法 从表位数据库中收集33条EBV抗原表位,使用逐步回归(STR)方法筛选2个对平衡解离常数(KD)贡献较大的结构参数用于表位的结构表征,最后用多元线性回归(MLR)方法建立结构参数与KD的定量构效关系(QSAR)模型.结果 该模型具有较好的稳定性(R2=0.637,Q2=0.581)与预测能力(R2test=0.501).结论 此方法可确定表位中各个氨基酸的物理性质对于平衡解离常数的贡献,为表位设计与改造提供直接线索;STR和MLR相结合建模方法具有物化意义明确、易于解释及操作简便易行等优点.
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基于深度学习的溶剂定量构效关系建模研究进展
深度学习
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构效关系
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文献信息
篇名
基于氨基酸性质的EB病毒抗原MHC-I类分子限制性表位的定量构效关系建模
来源期刊
免疫学杂志
学科
医学
关键词
EB病毒
表位
平衡解离常数
构效关系
肿瘤
年,卷(期)
2013,(1)
所属期刊栏目
技术与方法
研究方向
页码范围
59-63
页数
5页
分类号
R392.9
字数
语种
中文
DOI
五维指标
作者信息
序号
姓名
单位
发文数
被引次数
H指数
G指数
1
王远强
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林治华
45
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胡勇
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3.0
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纪永军
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研究主题发展历程
节点文献
EB病毒
表位
平衡解离常数
构效关系
肿瘤
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
免疫学杂志
主办单位:
第三军医大学
中国免疫学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-8861
CN:
51-1332/R
开本:
大16开
出版地:
重庆市沙坪坝区高滩岩
邮发代号:
78-32
创刊时间:
1985
语种:
chi
出版文献量(篇)
4652
总下载数(次)
25
总被引数(次)
27928
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:
the National Natural Science Foundation of China
官方网址:
http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:
青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:
数理科学
重庆市自然科学基金
英文译名:
官方网址:
http://law.ddvip.com/law/2006-09/11584979384040.html
项目类型:
重点项目
学科类型:
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