南方水稻黑条矮缩病毒江西分离物CP基因克隆及序列分析

• 作者: 傅军如 孙晓棠 崔汝强 朱昌兰 欧阳林娟 胡丽芳 贺晓鹏 贺浩华 边建民
• 来源期刊: 江西农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 南方水稻黑条矮缩病毒 CP基因 基因克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2013,（5）
• 所属期刊栏目: 植保科学
• 页码范围: 901-905
• 页数: 5页
• 分类号: S435.111.4
• 字数: 2792字
• 语种: 中文

摘要

根据GenBank已登陆的SRBSDV S10核苷酸序列设计引物,克隆SRBSDV江西分离物外壳蛋白(CP)基因,结合已公布的序列,通过生物信息学方法进行序列分析.结果表明,SRBSDV江西分离物CP基因全长1 674个核苷酸,推测编码557个氨基酸,与已报道的SRBSDV CP基因之间核苷酸同源性为97.5％～100％,氨基酸同源性为97.7％～100％.SRBSDV CP基因核苷酸序列高度保守,保守位点占全部位点的83.5％.没有发现重组事件.本研究首次报道根据系统发育进化树,SRBSDV可分为2大组群,不存在明显的地域和寄主分化.