猪黑皮质素受体1基因密码子偏好分析

• 作者: 刘西梅 华再东 华文君 张立苹 李莉 毕延震 肖红卫 郑新民
• 来源期刊: 江西农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 家猪 黑皮质素受体1基因 密码子偏好 聚类分析
• 年，卷（期）: 2013,（9）
• 所属期刊栏目: 动物科学
• 页码范围: 95-100
• 页数: 6页
• 分类号: S828
• 字数: 3930字
• 语种: 中文

摘要

遗传密码子是生命信息的基本遗传单位，每种氨基酸对应1～6个同义密码子。特定物种在长期进化中形成了适应自身基因环境的密码子使用偏好。运用CHIPS、CUPS和CodonW程序分析猪黑皮质素受体1基因密码子偏好，并与牛、羊、小鼠、人等多种动物的黑皮质素受体1基因密码子偏好进行比较，以期为转基因动物育种提供依据。结果表明，猪偏好使用以C、G结尾的密码子（96．88％），且在整个编码区序列中G＋C含量（67．81％）大于A＋T（32．19％），该基因在猪体内表达水平很高（CAI＝0．849），并且发现，猪的密码子偏好性与牛、犬等动物类似，明显不同于鲀、雀、獾、大猩猩等动物。要实现目的基因在猪MC1R基因中进行定点整合并成功表达和尽可能地提高其表达量，需对目的基因的部分密码子进行改造。