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摘要:
目的 探讨hsa-miR-133a在人食管鳞状细胞癌细胞株中的表达,并对其靶基因进行预测和生物信息学分析,为深入研究hsa-miR-133a的功能提供理论指导.方法 通过实时荧光定量PCR法,检测人食管鳞状细胞癌细胞株KYSE-150、Eca109和正常食管上皮细胞株Het-1A中hsa-miR-133a的相对表达;应用TargetScan、PicTar及miRanda预测hsa-miR-133a的靶基因,取三者预测结果的交集,并结合DIANALAB-TarBase5.0和miRTarBase两个实验证实的基因数据库,进行功能注释和通路富集分析.结果 人食管鳞状细胞癌细胞株KYSE150、Eca109中hsa-miR-133a的表达水平显著低于正常食管上皮细胞;hsa-miR-133a的靶基因显著富集在与肿瘤密切相关的AKT和p53信号通路.结论 hsa-miR-133a可能是参与调控食管鳞状细胞癌致病的靶基因.
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文献信息
篇名 hsa-miR-133a在人食管鳞状细胞癌细胞株中的表达及其生物信息学分析
来源期刊 肿瘤防治研究 学科 医学
关键词 hsa-miR-133a 生物信息学 食管鳞状细胞癌
年,卷(期) 2013,(11) 所属期刊栏目 基础研究
研究方向 页码范围 1018-1021
页数 分类号 R735.1
字数 语种 中文
DOI 10.3971/j.issn.1000-8578.2013.11.002
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 王建国 解放军第八二医院检验科 32 76 4.0 7.0
2 赵亚萍 解放军第八二医院检验科 15 31 3.0 4.0
3 谢晖 解放军第八二医院检验科 3 10 2.0 3.0
4 赵一奇 解放军第八二医院普外科 10 28 3.0 5.0
5 陈诚 解放军第八二医院检验科 3 7 1.0 2.0
6 陈桂媛 淮安市第一人民医院检验科 1 5 1.0 1.0
7 吴钦良 解放军第八二医院检验科 1 5 1.0 1.0
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研究主题发展历程
节点文献
hsa-miR-133a
生物信息学
食管鳞状细胞癌
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
肿瘤防治研究
月刊
1000-8578
42-1241/R
大16开
武汉市武昌卓刀泉南路116号
38-70
1973
chi
出版文献量(篇)
6590
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总被引数(次)
30165
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