百合肌动蛋白基因lilyActin的克隆与表达分析

• 作者: 冯慧颖 刘春 徐雷锋 明军 梁云 袁素霞 袁迎迎
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 百合 Actin基因 基因克隆 表达分析 内参基因
• 年，卷（期）: 2013,（7）
• 所属期刊栏目: 观赏植物
• 页码范围: 1318-1326
• 分类号: S682.2
• 语种: 中文

摘要

为了在百合功能基因表达研究中选择一个理想内参基因,依据岷江百合cDNA文库所获得的百合肌动蛋白(Actin)基因的EST序列,采用RACE技术进行该基因cDNA全长克隆,并利用实时荧光定量PCR分析其在不同组织中的表达模式,获得百合肌动蛋白基因cDNA全长序列(GenBank登录号:JX826390),命名为lilyActin.该基因cDNA全长1 367bp,其中,5'非编码区91bp,3'非编码区233bp,开放读码框1 134 bp,编码377个氨基酸.序列比对发现,该基因与其它15种植物肌动蛋白核苷酸序列的相似性均在80％以上,氨基酸序列的相似性达98％.进化分析显示,百合肌动蛋白与郁金香肌动蛋白的亲缘关系最近.实时荧光定量PCR结果显示,该基因在百合的花蕾、叶片和鳞片组织中恒定表达,表明相对于其他物种的内参基因,lilyActin更适宜作为百合属植物的内参基因.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘春	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	53	1027	17.0	31.0
2	明军	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	41	1002	16.0	31.0
3	袁素霞	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	22	315	12.0	17.0
4	徐雷锋	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	8	96	5.0	8.0
5	袁迎迎	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	5	71	4.0	5.0
6	梁云	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	4	36	3.0	4.0
7	冯慧颖	中国农业科学院蔬菜花卉研究所	2	32	2.0	2.0