为了全面客观地反映人为干扰对河流生态系统的影响,不同国家和地区基于鱼类、硅藻、大型无脊椎动物等水生生物对人为干扰的生态响应,采用其中一种或多种水生生物建立了一系列能够反映当地河流健康状况的评价方法,其中基于鱼类的评价仍然注重生物完整性指数(index of biotic integrity)的完善和应用;基于藻类的河流健康评价应用范围较为广泛;在所有评价方法中,基于大型无脊椎动物的河流健康评价仍然占据主导地位.在评价指标体系的构建上,除了在群落结构和功能层面上评价河流健康外,还建立了基于科、属、种等各级生物分类单元的评价方法.在基于各类指示生物的评价方法中,多指标评价方法是目前河流健康评价最为常见的方法,但多指标评价方法对指标之间信息冗余程度的考虑还比较欠缺,指标体系能否长期使用还有待进一步探索.