布莱凯特黑牛CoQ10合成相关基因COQ2cDNA克隆及其多态性分析

• 作者: 张新浩 杨莉 柏学进 牛召珊 董雅娟 赵仕全
• 来源期刊: 畜牧与兽医
• 学科: 农学
• 关键词: 布莱凯特黑牛 CoQ10 COQ2基因 cDNA PCR-SSCP
• 年，卷（期）: 2013,（10）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 31-35
• 页数: 5页
• 分类号: S813.23
• 字数: 3539字
• 语种: 中文

摘要

COQ2基因是真核生物中对羟基苯甲酸聚异戊二烯焦磷酸转移酶的编码基因,该酶是CoQ10生物合成过程的主要限速酶.试验根据已公布的普通牛COQ2基因序列和其cDNA序列,对COQ2基因的7个外显子区域进行引物设计.PCR产物克隆测序后,使用生物信息学软件对测序结果进行比对和拼接,得到布莱凯特黑牛COQ2基因cDNA序列,并对其外显子3进行了PCR-SSCP分析.结果表明:布莱凯特黑牛COQ2基因cDNA序列长1 546 bp,由7个外显子组成,氨基酸编码序列为第46 bp至1 161 bp处,编码371个氨基酸;与普通牛相比,布莱凯特黑牛PPT氨基酸第324位由天冬氨酸(N)突变为组氨酸(H).SSCP检测发现外显子3中存在一个多态位点,在102 bp处发生A→T的碱基突变,产生了AA、AB、BB三种基因型,分析发现AB基因型频率最高,B等位基因频率(0.533)比C等位基因(0.467)高,为优势等位基因.该位点多态信息含量(PIC=0.374)为中度多态.该结果为进一步分析COQ2基因SNP位点与布莱凯特黑牛CoQ10合成情况及肉质性状的关联性奠定了基础,对布莱凯特黑牛品种培育具有重要的指导意义.