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硝普钠(SNP)和茉莉酸甲酯(MeJA)诱导的白桦Ty1-copia类逆转座子的克隆及分析
硝普钠(SNP)和茉莉酸甲酯(MeJA)诱导的白桦Ty1-copia类逆转座子的克隆及分析
作者:
曾凡锁
李博
梁楠松
詹亚光
郭梁
原文服务方:
东北林业大学学报
白桦
Tyl-copia类逆转座子
逆转录酶
转录活性
系统进化
异质性
简并杂交寡核苷酸引物
摘要:
利用 Tyl-copia类逆转座子逆转录酶( RT)的保守区域设计引物,优化了扩增条件后利用RT-PCR从白桦愈伤组织中得到了1条逆转录酶序列。利用硝普钠( SNP)和茉莉酸甲酯( MeJA)诱导后分别扩增克隆了11条和9条逆转录酶序列。这21条逆转录酶序列(命名Bprt1-21)变化范围为205~290 bp,一致性为71.93%,异质性为11.%~50.9%,翻译成氨基酸的异质性为0~57.1%。经SNP和MeJA处理的样品中,获得的逆转录酶序列基本是分别聚类,初步证明不同的Ty1-copia类逆转座子能够分别响应不同的信号而被转录激活。分析所获得的21逆转录酶序列和苹果中19条逆转录转座子序列( DQ410748~DQ410766)进化关系发现,逆转录酶基本各自聚类,但是Bprt9、Bprt11和DQ410750进化关系比较接近,Bprt15、Bprt19、DQ410751和DQ410753聚为一类,证明逆转座子存在水平传递。
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篇名
硝普钠(SNP)和茉莉酸甲酯(MeJA)诱导的白桦Ty1-copia类逆转座子的克隆及分析
来源期刊
东北林业大学学报
学科
关键词
白桦
Tyl-copia类逆转座子
逆转录酶
转录活性
系统进化
异质性
简并杂交寡核苷酸引物
年,卷(期)
2013,(10)
所属期刊栏目
研究方向
页码范围
69-74
页数
6页
分类号
Q789
字数
语种
中文
DOI
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作者信息
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单位
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1
詹亚光
162
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19.0
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李博
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曾凡锁
49
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4
梁楠松
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逆转录酶
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简并杂交寡核苷酸引物
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研究来源
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相关学者/机构
期刊影响力
东北林业大学学报
主办单位:
东北林业大学
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-5382
CN:
23-1268/S
开本:
大16开
出版地:
邮发代号:
创刊时间:
1957-01-01
语种:
chi
出版文献量(篇)
7235
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0
总被引数(次)
68015
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