虹鳟MHC-UBA基因遗传多样性分析

• 作者: 刘哲 杨娟 王建福 胡丹丹 邵淑娟
• 来源期刊: 生物技术通报
• 关键词: 虹鳟 UBA基因 克隆测序 遗传多样性
• 年，卷（期）: 2013,（7）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 99-106
• 语种: 中文

摘要

主要组织相容性复合体(Major histocompatibility complex,MHC)是存在于脊椎动物体内,与免疫功能密切相关的高度多态性基因群,也是研究适应性进化过程的最佳候选基因之一.采用PCR-SSCP及克隆测序的方法分析了184尾虹鳟MHC Ⅰ类UBA基因第2外显子的遗传多样性.结果共检出12个等位基因,其中有11个为首次发现.单个个体最多存在4种等位基因,预示虹鳟UBA基因可能存在2个以上拷贝位点.12种等位基因同源性在98.08％-99.23％之间,核苷酸变异位点百分率6.13％,氨基酸变异位点百分率17.44％.抗原肽结合区(PBR)和非抗原肽结合区(non-PBR)的非同义替换率(dN)均显著大于同义替换率(dS)(P＜0.001),说明虹鳟UBA基因在进化过程中受到正向选择的作用.氨基酸组分和密码子使用偏性分析表明各同义密码子使用频率不均衡.系统发育分析结果显示,虹鳟UBA基因与大西洋鲑UBA基因亲缘关系较近.研究结果表明,虹鳟UBA基因具有丰富的遗传多样性,可望作为抗病育种应用中的一个潜在遗传标记.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘哲	甘肃农业大学动物科学技术学院	65	403	11.0	18.0
2	胡丹丹	甘肃农业大学动物科学技术学院	4	8	2.0	2.0
3	王建福	甘肃农业大学动物科学技术学院	43	147	7.0	10.0
4	邵淑娟	甘肃农业大学动物科学技术学院	5	9	2.0	3.0
5	杨娟	甘肃农业大学动物科学技术学院	8	107	6.0	8.0