基于昆虫气味结合蛋白的新型酰基哌啶类化合物的构效关系

• 作者: 彭炜 李冬玲 段红霞 王珊珊 赵静馥 陈文雅
• 来源期刊: 高等学校化学学报
• 学科: 化学
• 关键词: 气味结合蛋白 酰基哌啶类化合物 昆虫驱避剂 分子对接 三维定量构效关系
• 年，卷（期）: 2013,（12）
• 所属期刊栏目: 物理化学
• 页码范围: 2798-2805
• 页数: 8页
• 分类号: O641
• 字数: 6028字
• 语种: 中文
• DOI: 10.7503/cjcu20130656

摘要

利用Sybyl7.3软件对29个具有驱避活性的新型酰基哌啶类化合物与气味结合蛋白AgamOBP1的结合模式进行研究,发现二者之间的结合以疏水作用和水桥作用为主.其中酰基哌啶类化合物末端的疏水片段可与AgamOBP1结合腔内狭长的疏水通道产生相互作用.同时,其关键药效基团——酰基氧可通过HOH153与AgamOBP1中的关键残基Trp114和Gly92或Cys95形成多重氢键作用.利用比较分子力场分析法(CoMFA)和比较分子相似性指数分析法(CoMSIA)构建了新型酰基哌啶类化合物的三维定量构效关系(3D-QSAR)模型,其交叉验证系数T2ev分别为0.650和0.587.研究表明,在CoMSIA模型中,疏水场、静电场和立体场组合所得的三维构效关系模型最佳,其中尤以疏水场对这类酰基哌啶类化合物的驱避活性最为重要.基于AgamOBP1靶标结合口袋特征和酰基哌啶类化合物的3D-QSAR模型得出具有驱避活性的酰基哌啶类化合物的构效关系如下:在酰基C上引入一定碳链长度的疏水基团可使化合物表现出驱避活性,其中又以含9～10个C的化合物的驱避活性最佳,这与AgamOBP1结合口袋的疏水性质密不可分;当酰基端碳链长度一定时,在哌啶环上不宜引入立体效应过大的取代基,这是由AgamOBP1结合口袋的大小决定的;与哌啶N相连的酰基作为氢键受体基团,对于化合物识别与结合AgamOBP1蛋白至关重要.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王珊珊	中国农业大学理学院应用化学系	14	29	2.0	5.0
2	段红霞	中国农业大学理学院应用化学系	11	52	4.0	7.0
3	李冬玲	中国农业大学理学院应用化学系	3	26	1.0	3.0
4	陈文雅	中国农业大学理学院应用化学系	6	8	2.0	2.0
5	彭炜	中国农业大学理学院应用化学系	2	25	1.0	2.0
6	赵静馥	中国农业大学理学院应用化学系	1	1	1.0	1.0