稻瘟病菌假定几丁质酶家族基因的表达特点

• 作者: 周洁 林成增 王宗华 王琴秋 韩艺娟 鲁国东
• 来源期刊: 热带作物学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 稻瘟病菌 几丁质酶 Real-time PCR 表达
• 年，卷（期）: 2013,（8）
• 所属期刊栏目: 作物病虫害及防治、环境保护
• 页码范围: 1544-1551
• 页数: 8页
• 分类号: Q556.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-2561.2013.08.025

摘要

在稻瘟病菌基因组数据库中检索到15个假定几丁质酶相关基因,借助生物信息学分析,发现这些几丁质酶均具有糖苷水解酶18家族结构域,有的还具有几丁质结合功能域；亚细胞定位分析表明,8个编码蛋白定位在细胞外,其余分别定位在细胞质和线粒体.通过与酵母几丁质酶CTS1与CTS2的聚类分析,发现这些假定几丁质酶可以分为2大类,其中11个假定几丁质酶与CTS2聚为一类,即CTS2同源蛋白；其余4个与CTS1聚为一类,即CTS1同源蛋白.在此基础上,本研究进一步通过Real-time PCR技术分析这些假定几丁质酶编码基因在稻瘟病菌菌丝生长、孢子形成、芽管萌发和附着孢形成阶段的表达模式.结果显示,除了MGG_01876.6,其他14个基因在稻瘟病菌不同生长发育阶段均有表达,说明几丁质酶家族蛋白可能参与稻瘟病菌的生长发育、形态建成和致病过程.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	鲁国东	福建农林大学植物保护学院	72	538	13.0	21.0
2	王宗华	福建农林大学生命科学院	74	760	17.0	25.0
3	韩艺娟	福建农林大学生命科学院	3	7	2.0	2.0
4	林成增	福建农林大学生命科学院	5	15	3.0	3.0
5	王琴秋	福建农林大学生命科学院	4	10	2.0	3.0
6	周洁	福建农林大学生命科学院	14	115	4.0	10.0