秀丽线虫野生株系N2缺氧的荧光定量蛋白质组学研究

• 作者: 刘丹丹 夏靖 孔玲 李华玲 秦艳 胡竹林 陈文飞
• 来源期刊: 安徽医科大学学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 秀丽线虫 野生株系(N2) 荧光定量蛋白质组学 过氧还蛋白
• 年，卷（期）: 2013,（11）
• 所属期刊栏目: 基础医学研究
• 页码范围: 1292-1296
• 页数: 5页
• 分类号: Q816
• 字数: 4535字
• 语种: 中文

摘要

目的研究秀丽线虫野生株系N2缺氧时的差异蛋白质,为进行线虫在缺氧环境下的应答机制研究奠定基础。方法同步化培养N2株系的线虫,培养至L4期时物理缺氧10 h(0.2% O2)后,提取总蛋白,采用双向荧光差异凝胶电泳(DIGE)分离和串联质谱分析,搜索线虫数据库,鉴定蛋白种类并进行分析。并采用突变株系(prdx-2, prdx-3)进行了4、6、8、10、12 h的缺氧实验研究。结果质谱成功鉴定了其中的5个与对照有显著差异的蛋白质(ratio>2.0,P<0.05),包括2个上调( PRDX-2、 PRDX-3)和3个( RPL-7、H28O16.1、VHA-12)下调的蛋白。突变株系的缺氧存活率实验进一步验证了蛋白质组学的结果,也显示了PRDX-2和PRDX-3在抗缺氧中起重要作用。结论蛋白质组学的方法为线虫缺氧的研究提供了有参考价值的数据,缺氧10 h后,线虫中变化的蛋白质与能量、翻译和抗氧化有关,为进一步研究缺氧时的应答机制奠定了基础。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孔玲	扬州大学医学院生物化学教研室	10	3	1.0	1.0
2	李华玲	扬州大学医学院生物化学教研室	25	33	4.0	4.0
3	秦艳	扬州大学医学院生物化学教研室	3	2	1.0	1.0
4	刘丹丹	扬州大学医学院生物化学教研室	27	50	4.0	6.0
5	夏靖	扬州大学医学院生物化学教研室	1	0	0.0	0.0
6	胡竹林	扬州大学医学院生物化学教研室	1	0	0.0	0.0
7	陈文飞	扬州大学医学院生物化学教研室	11	24	4.0	4.0