建泽泻鲨烯合酶基因克隆及其生物信息学分析

• 作者: 吴启南 周娟娟 徐飞 申修源 谷巍 高杰
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 建泽泻 鲨烯合酶 基因克隆 原萜烷型三萜 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2013,（5）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 604-609
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2013.05.021

摘要

目的 对建泽泻原萜烷型三萜类成分生物合成关键酶鲨烯合酶(squalene synthase,SS)进行基因全长的克隆和生物信息学分析.方法 以建泽泻总RNA为模板,运用同源克隆法和RACE技术克隆建泽泻SS基因的cDNA全长,并通过DNAMAN软件及ExPASy在线分析等方法对其进行生物信息学研究.结果 获得建泽泻SS基因全长cDNA,GenBank注册号为JX866770,序列分析表明,所克隆的cDNA序列全长为1577bp,包含一个长1230bp的开放阅读框架,编码409个氨基酸的蛋白,与其他药用植物具有较高的同源性.预测该蛋白的相对分子质量为4.68×104,等电点为5.97,无信号肽,包含2个富含天冬氨酸(DXXDD)的保守功能域.结论 首次克隆获得建泽泻SS基因的全长cDNA,为泽泻原萜烷型三萜类成分生物合成途径阐明与生物工程应用提供科学依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴启南	南京中医药大学药学院	151	1620	21.0	32.0
2	谷巍	南京中医药大学药学院	107	592	13.0	17.0
4	徐飞	南京中医药大学药学院	27	129	7.0	9.0
5	周娟娟	南京中医药大学药学院	13	67	5.0	8.0
6	高杰	南京中医药大学药学院	5	39	4.0	5.0
7	申修源	南京中医药大学药学院	6	49	4.0	6.0