2011-2012年我国部分地区猪流行性腹泻病毒ORF3基因的遗传变异分析

• 作者: 何孔旺 俞正玉 倪艳秀 刘浩飞 李彬 温立斌 王小敏 茅爱华 郭容利
• 来源期刊: 畜牧与兽医
• 学科: 农学
• 关键词: 猪流行性腹泻病毒(PEDV) ORF3基因 遗传变异
• 年，卷（期）: 2013,（5）
• 所属期刊栏目: 试验研究
• 页码范围: 1-4
• 页数: 4页
• 分类号: S852.65|S858.28
• 字数: 3378字
• 语种: 中文

摘要

应用RT-PCR方法对江苏、安徽、山东、江西、河北、上海、北京等省市的146份腹泻仔猪的小肠组织和粪便样本进行猪流行性腹泻病毒(PEDV)检测.结果:146份腹泻病料中共检出82份PEDV阳性样品,阳性率为56.2％;对其中14份阳性病料的ORF3基因进行测序,将所测序列与GenBank中PEDV参考毒株的ORF3序列进行分析比较,并绘制了系统进化树.所测14个PEDV ORF3序列与GenBank中的38个参考毒株ORF3核苷酸序列同源性为93％～ 100％;ORF3基因系统进化树分析表明PEDV分为3组,13个病毒属于PEDV3组,另外1个属于PEDV 1组.ORF3遗传变异分析表明:中国最近流行的PEDV野毒株与韩国野毒株关系密切,但与欧洲株以及中国目前使用的疫苗株基因差异较大.