不同地理群体的鲇线粒体DNA 16S rRNA基因序列比较分析

• 作者: 唐立俊 喻哓丹 宋培勇 王庆容
• 来源期刊: 广东农业科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 鲇 线粒体DNA 遗传多样性 16S rRNA基因
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 生物技术
• 页码范围: 150-153
• 页数: 4页
• 分类号: Q812
• 字数: 2686字
• 语种: 中文

摘要

对长江中上游主要支流5个野生群体鲇[舞阳河群体(WYH)、乌江群体(WJ)、雅砻江群体(YLJ)、岷江群体(MJ)、金沙江群体(CS)]中的27个样品的16S rRNA基因进行PCR扩增,并对扩增产物测序.用CLUSTAL X v 1.81软件对所得的27个16SrRNA序列进行比对,并用Dna SP 5.10软件进行比较分析,共检测出74个变异位点、8种单倍型.舞阳河、乌江、雅砻江、岷江、金沙江等5个野生群体的单倍型多样性(H)分别为0.600、0.857、0.600、0.600、0.667,核苷酸多样性(π)分别为0.00072、0.1754、0.00036、0.00072、0.01871.对5个野生群体的16S rRNA序列进行Tajima's D和Fst分析发现,所有群体符合中性进化模型,且有一些单倍型的分化,只有金沙江群体的遗传差异显著.对5个群体进行分子变异等级分析的结果表明,群体间分子变异不显著.对5个群体构建分子系统树发现,乌江、雅砻江、岷江、金沙江群体之间的亲缘关系较近,舞阳河群体与其他群体间的亲缘关系较远.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	唐立俊	遵义师范学院生物系	24	50	4.0	6.0
2	王庆容	遵义师范学院生物系	28	75	5.0	8.0
3	宋培勇	遵义师范学院生物系	39	136	7.0	10.0
4	喻哓丹	遵义师范学院生物系	1	3	1.0	1.0