宁夏枸杞查耳酮合成酶基因cDNA片段的克隆及生物信息学分析

• 作者: 尚洁 潘伟志 陈阿丽
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 枸杞 CHS基因 克隆 生物信息学分析 LyCHS蛋白
• 年，卷（期）: 2013,（20）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 2898-2903
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2013.20.020

摘要

目的 克隆宁夏枸杞类黄酮/异黄酮生物合成途径中的关键酶查耳酮合成酶(CHS,EC2.3.1.74).方法 以宁夏枸杞为材料,利用同源克隆和RT-PCR技术得到1条CHS基因,并对其进行生物信息学分析.结果 该家族的cDNA片段长为1 148 bp,编码382个氨基酸,蛋白相对分子质量为4.168×104,等电点为6.22.氨基酸序列和结构分析显示CHS基因家族有一个活性位点,即查耳酮和二苯乙烯合成酶活性位点.宁夏枸杞CHS (LyCHS)蛋白很可能定位在细胞质.对二级结构和三级结构进行预测,发现LyCHS蛋白中无规则卷曲126个,α螺旋和β折叠分别为166和25个,延伸链65个.系统进化分析表明,LyCHS基因与马铃薯野生种、马铃薯、番茄具有很高的同源性.该基因已在GenBank上注册,基因序列登录号为JQ964237.结论 首次克隆了LyCHS基因片段,为研究其表达特性以及功能提供了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈阿丽		11	33	4.0	5.0
2	尚洁	北方民族大学生物科学与工程学院	14	47	4.0	6.0
3	潘伟志	华中科技大学生命科学与技术学院	1	5	1.0	1.0