碎米桠及其近缘种的分子鉴定和亲缘关系研究

• 作者: 夏至 张红瑞 李贺敏 高致明
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: ITS psbA-trnH 碎米桠 鉴定 亲缘关系
• 年，卷（期）: 2013,（20）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 2904-2909
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2013.20.021

摘要

目的 构建碎米桠Isodon rubescens及其与近缘种之间系统发育关系,准确鉴别碎米桠及其近缘种.方法 提取碎米桠及其近缘种DNA,对核基因ITS片段和叶绿体基因psbA-trnH序列扩增和测序,计算物种种内、种间Kimura 2-parameter(K2P)遗传距离.采用最近距离、相似性搜索、构建Neighbor-joining (NJ)系统聚类树3种方法进行鉴定分析.结果 ITS和sbA-trnH 分子系统树支持碎米桠5个居群样本聚为一单系分支,支持率为94％和68％；其中,碎米桠与毛叶香茶菜、香茶菜和内折香茶菜聚在一支,支持率为70％和51％；溪黄草和显脉香茶菜构成姐妹群分支,支持率为81％和63％.碎米桠及其近缘种种间ITS和sbA-trnH序列的K2P遗传距离为0.007 08～0.072 61和0.008 06～0.024 76,均远大于碎米桠种内的遗传距离0～0.001 76和0～0.002 68.结论 碎米桠与毛叶香茶菜、香茶菜和内折香茶菜亲缘关系较近,溪黄草和显脉香茶菜亲缘关系最近.ITS和sbA-trnH序列可以准确鉴别碎米桠及其近缘种.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	高致明	河南农业大学农学院中药材工程技术研究中心	118	694	14.0	19.0
2	李贺敏	河南农业大学农学院中药材工程技术研究中心	60	275	8.0	13.0
3	夏至	河南农业大学农学院中药材工程技术研究中心	28	174	8.0	11.0
4	张红瑞	河南农业大学农学院中药材工程技术研究中心	87	376	10.0	13.0