西洋参β-香树脂合成酶基因的克隆和生物信息学分析

• 作者: 吴琼 孙超 陈士林
• 来源期刊: 中草药
• 学科: 医学
• 关键词: 西洋参 β-香树脂合成酶 分子克隆 实时荧光定量PCR RACE
• 年，卷（期）: 2013,（11）
• 所属期刊栏目: 药材与资源
• 页码范围: 1476-1480
• 分类号: R282.12
• 语种: 中文
• DOI: 10.7501/j.issn.0253-2670.2013.11.022

摘要

目的 克隆西洋参三萜皂苷生物合成途径关键酶β-香树脂合成酶(bAS)全长cDNA,为研究西洋参皂苷生物合成与次生代谢调控奠定基础.方法 采用大规模ESTs测序和cDNA末端扩增(RACE)技术克隆西洋参bAS基因.结果 获得了西洋参bAS基因全长cDNA,命名为PqbAS(GenBank注册号:JX185490),其核苷酸序列长度为2 309 bp,含有1个开放阅读框,编码631个氨基酸多肽.保守结构域搜索显示PqbAS含有环氧角鲨烯环化酶(OSCs)共有的活性位点和保守基序.Singal P4.0分析表明PqbAS属于非分泌型蛋白,Tmhmm 2.0分析表明其为非跨膜蛋白.实时荧光定量PCR显示PqbAS基因在各个器官中均有表达,在花和幼茎中高表达,根和叶中表达量相对较低.结论 首次克隆了PqbAS基因全长序列,为研究其表达特性以及在三萜皂苷生物合成中的功能奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	陈士林	中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所	143	2855	29.0	43.0
2	孙超	中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所	28	393	11.0	19.0
3	吴琼	桂林医学院药学院	9	37	3.0	6.0