嗜水气单胞菌拮抗芽孢杆菌抗菌素相关基因分析

• 作者: 何珊 吕利群 曹海鹏 王会聪
• 来源期刊: 食品科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 解淀粉芽孢杆菌 抗菌素相关基因 伊枯草菌素合成必需基因 系统发育分析
• 年，卷（期）: 2013,（1）
• 所属期刊栏目: 生物工程
• 页码范围: 171-174
• 页数: 4页
• 分类号: Q939.97
• 字数: 3254字
• 语种: 中文

摘要

分别对抗鲟源嗜水气单胞菌的解淀粉芽孢杆菌G1的抗菌素相关基冈进行PCR扩增与测序,并对其编码产物的氨基酸序列、跨膜螺旋信号、结构域与二级结构等进行预测与分析.结果表明:菌株G1仪含有伊枯草菌素合成必需基因,该基因与GenBank基因库中芽孢杆菌属其他细菌的伊枯草菌素A、杆菌抗霉素D、抗霉枯草菌素等伊枯草菌素家族基因自然聚类,与枯草芽孢杆菌MH25株和RB14株的伊枯草菌素A基因16S rRNA序列有98％的高度同源性,而且其编码产物的氨基酸序列与GenBank中芽孢杆菌属其他细菌的伊枯草菌素、伊枯草菌素A、脂肽类化合物Bacillorin、芽孢菌素D等抗菌物质的氨基酸序列有高度同源性,与枯草芽孢杆菌MH25的伊枯草菌素A合成酶B(GenBank登录号:ABY89499)的亲缘关系最近.此外,菌株G1伊枯草菌素合成必需基因的编码产物不具有明显的跨膜结构,但其结构域中存在AMP结合位点和PP结合位点,二级结构中存在a螺旋、伸展链、β转角和无规则卷曲.