基于信息量的DNA序列相似性分析

• 作者: 张家录 程杰仁 陈雪刚
• 来源期刊: 计算机应用研究
• 关键词: DNA序列比较 数据库系统 信息量 相似性
• 年，卷（期）: 2013,（5）
• 所属期刊栏目: 算法研究探讨
• 页码范围: 1381-1384
• 页数: 4页
• 分类号: TP391
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-3695.2013.05.025

摘要

针对传统方法在分析DNA序列相似性方面的不足,提出了一种新的基于信息量的DNA序列相似性分析算法,该方法将DNA序列视为基于符号集{A,C,G,T}的信号序列,全部待比较的DNA序列组合成一个以字符A、C、G、T为属性值的信息系统.在所得数据库系统中引进DNA序列的信息量、联合信息量、条件信息量、交互信息量等概念,讨论这些信息量的性质并给出它们之间的一些关系式,然后在此基础上构建DNA序列相似性分析模型.仿真实验结果表明,该方法不但能快速、有效地分析DNA序列相似性,而且较好地克服了DNA碱基数量很大且不同物种的DNA序列长短不同的不足.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	张家录	湘南学院数学系	51	133	6.0	9.0
2	陈雪刚	湘南学院计算机系	27	90	6.0	8.0
3	程杰仁		3	16	2.0	3.0