环形泰勒虫微线体-棒状体蛋白基因侧翼序列的hiTAIL-PCR扩增及其生物信息学分析

• 作者: 何海宁 关贵全 刘志杰 岑双庆 张晓 李有全 杨吉飞 牛庆丽 陈泽
• 来源期刊: 中国兽医科学
• 学科: 农学
• 关键词: 环形泰勒虫 RT-PCR 微线体-棒状体蛋白 hiTAIL-PCR 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 页码范围: 1-6
• 页数: 6页
• 分类号: S852.723
• 语种: 中文

摘要

为扩增环形泰勒虫微线体-棒状体蛋白基因的侧翼序列,从感染环形泰勒虫的淋巴细胞系中提取RNA,反转录合成第1链cDNA.以该cDNA为模板,利用高效热不对称交互PCR法(hiTAIL-PCR)进行扩增,将目的片段连接到pGEM-T Easy载体并进行测序.结果显示,获得了环形泰勒虫微线体-棒状体蛋白基因的5’端侧翼序列,该序列编码894个氨基酸.生物信息学分析结果表明,该蛋白具有信号肽,信号肽剪切部位位于第19～20个氨基酸残基之间,很可能是一种分泌蛋白;经TMHMM2.0预测,该蛋白在第875～892位氨基酸残基部位具有典型的跨膜结构;Motif scan预测的结果显示,环形泰勒虫微线体-棒状体蛋白存在2处N-糖基化位点(153NLSF、333NESM)和15处CK2蛋白激酶磷酸化位点;在该蛋白第500～650位氨基酸残基部分具有较高的抗原性,推测可能是该蛋白与其他蛋白发生相互作用的区域.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李有全	中国农业科学院兰州兽医研究所	28	27	3.0	5.0
2	关贵全	中国农业科学院兰州兽医研究所	33	77	6.0	8.0
3	刘志杰	中国农业科学院兰州兽医研究所	16	4	1.0	2.0
4	张晓	中国农业科学院兰州兽医研究所	19	107	4.0	10.0
5	陈泽	中国农业科学院兰州兽医研究所	10	27	2.0	5.0
6	牛庆丽	中国农业科学院兰州兽医研究所	7	32	1.0	5.0
7	杨吉飞	中国农业科学院兰州兽医研究所	10	0	0.0	0.0
8	岑双庆	中国农业科学院兰州兽医研究所	3	0	0.0	0.0
9	何海宁	中国农业科学院兰州兽医研究所	4	0	0.0	0.0