茶树CsActin1基因密码子偏性分析

• 作者: 刘振 成杨 杨培迪 杨阳 赵洋
• 来源期刊: 茶叶通讯
• 学科: 农学
• 关键词: 茶树(Camellia sinensis) 肌动蛋白 密码子偏性
• 年，卷（期）: 2014,（4）
• 页码范围: 13-17
• 页数: 5页
• 分类号: S571.1
• 字数: 3049字
• 语种: 中文

摘要

运用CUSP、CodonW、CHIPS程序分析茶树肌动蛋白基因CsActin1的密码偏性,并将其与茶树基因组密码子偏性比较,以及与其它9种植物肌动蛋白基因进行基于密码子偏性和CDS序列的聚类分析.结果显示,CsA ctin1相对密码子使用度(RSCU)与茶树基因组比较,只有6种氨基酸的密码子偏性一致,且没有如茶树基因组一样偏好使用A/T结尾的密码子,肌动蛋白基因基于RSCU的聚类结果与基于CDS序列的聚类结果虽存在差异,但都能在一定程度上反映物种间的亲缘关系.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杨阳		20	92	6.0	8.0
2	赵洋		11	60	4.0	7.0
3	杨培迪		9	50	4.0	6.0
4	刘振		11	55	4.0	7.0
5	成杨		8	46	3.0	6.0