基于生物信息学对NAD(P)H辅酶氧化酶的结构识别

• 作者: 方柏山 李昊 李红春 王世珍 王雅丽
• 来源期刊: 生物物理学
• 学科: 生物学
• 关键词: 辅酶氧化酶 生物信息学 核心结构域 构效关系 活性位点
• 年，卷（期）: swwlx_2014,（3）
• 页码范围: 30-37
• 页数: 8页
• 分类号: Q7

摘要

辅酶再生是推动氧化还原酶大规模工业化应用的关键。辅酶氧化酶(NOX)是工业上用于NADH和NADPH再生的理想用酶。基于序列比对等生物信息学手段,分析NOX的氨基酸序列和蛋白质高级结构特点,为今后对辅酶氧化酶的识别和改造研究奠定基础。基于生物信息学的方法,利用ClustalX 2.0、PyMOL 1.0等相关软件,对来源于粪肠球菌(Enterococcus faecalis),乳酸链球菌(Lactococcus lactis),詹氏甲烷球菌(Methanocaldococcus jannaschii),生殖支原体(Mycoplasma genitalium),肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae),化脓链球菌(Streptococcus pyogenes)中的辅酶氧化酶(已知型或推断型)进行序列比对、同源建模,分析其催化活性位点、活性位点的氨基酸残基保守性特点及反应机理,识别辅基及周围重点氨基酸残基。大量的比对分析结果表明,NOX的催化活性位点存在重点作用残基Cys42和辅基FAD,周围存在高度保守性残基His10,Leu40或Ser40和Gly43。研究结果可用于今后指导酶的筛选,在分子层面修饰和酶结构的改造。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	方柏山	厦门大学化学化工学院	25	86	5.0	7.0
2	李昊	厦门大学化学化工学院	6	6	1.0	2.0
3	王世珍	厦门大学化学化工学院	7	9	2.0	2.0
4	王雅丽	厦门大学化学化工学院	7	25	3.0	4.0
5	李红春	厦门大学化学化工学院	1	0	0.0	0.0