盐胁迫下两个甜瓜品种转录因子的转录组分析

• 作者: 张利达 张屹东 张芙蓉 陈嘉贝 黄丹枫
• 来源期刊: 植物生理学报
• 关键词: 甜瓜 盐胁迫 高通量测序 转录因子 转录组分析
• 年，卷（期）: 2014,（2）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 150-158
• 页数: 9页
• 语种: 中文

摘要

利用新一代高通量测序手段——转录组测序(RNA-Seq)技术研究在300 mmol·L-1 NaCl胁迫下两个甜瓜(Cucumis melo L.)品种‘玉露,和‘冰雪脆’的转录因子基因表达变化.这两个甜瓜品种在叶绿素荧光参数上的差异表明其在盐胁迫下有不同的生理反应.转录组测序结果表明,盐胁迫与对照相比,‘玉露’共有属于19个转录因子家族的56个转录因子基因表达发生变化(在转录水平,属于7个转录因子家族的22个转录因子上调表达,属于14个转录因子家族的34个转录因子下调表达).‘冰雪脆’有属于20个转录因子家族的47个转录因子基因表达发生变化(在转录水平上,属于5个转录因子家族的17个转录因子上调表达,属于17个转录因子家族的30个转录因子下调表达).盐胁迫下,两个甜瓜品种差异表达的转录因子既表现特异性,也存在部分重叠.‘玉露’有29个转录因子特异响应,‘冰雪脆’有20个特异响应.盐胁迫响应重叠的转录因子有27个,其中9个上调表达,18个下调表达.采用实时荧光定量PCR对几个转录因子进行了盐胁迫下的表达检测,其趋势与转录组分析结果基本一致.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄丹枫		195	2451	25.0	40.0
2	张利达		6	69	3.0	6.0
3	张芙蓉		3	16	2.0	3.0
4	张屹东		14	57	3.0	7.0
5	陈嘉贝		1	0	0.0	0.0