毛果杨NLP基因家族生物信息学分析与鉴定

• 作者: 刘关君 吴翔宇 孙琦 曲春浦 李蔚 许志茹
• 来源期刊: 植物研究
• 学科: 农学
• 关键词: 毛果杨 NLP 基因家族 表达模式
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 37-43,61
• 页数: 8页
• 分类号: S792.11
• 语种: 中文
• DOI: 10.7525/j.issn.1673-5102.2014.01.006

摘要

NLP基因家族是一类特殊的转录因子,豆科植物根瘤的形成依赖于该基因家族的存在,在非豆科植物中具有调节植物硝酸盐吸收以及同化的功能.通过对毛果杨(Populus trichocarpa)基因组的生物信息学分析,共鉴定出14个毛果杨NLP基因家族成员,这些成员具有低亲水性的特点,基因结构保守,都含有RWP-RK以及PB1两个保守结构域.通过细胞定位预测,所有成员都定位在细胞核中.直系同源与旁系同源进化分析显示,NLP基因家族成员在漫长的进化过程中经历了严格的选择.染色体定位分析表明,毛果杨NLP基因家族成员坐落在毛果杨9条染色体之上,成员数量的扩增来自于杨柳科染色体自身的扩增事件.芯片数据分析结果显示,NLP基因家族成员在嫩叶,根和雄花中表达,部分基因在木质部以及种子萌发过程之中表达,但所有成员均不在成熟叶片中表达.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	许志茹		44	355	10.0	18.0
2	刘关君		53	527	12.0	22.0
3	孙琦		5	13	2.0	3.0
4	曲春浦		20	20	3.0	4.0
5	李蔚		2	0	0.0	0.0
6	吴翔宇		2	0	0.0	0.0