高温胁迫下坛紫菜的数字基因表达谱研究

• 作者: 严小军 杨锐 赖晓娟 陈海敏 骆其君
• 来源期刊: 海洋学报（中文版）
• 学科: 农学
• 关键词: 坛紫菜 高温胁迫 数字基因表达谱(DGE) 差异表达基因 响应
• 年，卷（期）: 2014,（6）
• 所属期刊栏目: 论文
• 页码范围: 104-111
• 页数: 8页
• 分类号: S917.3
• 字数: 4539字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.0253-4193.2014.06.013

摘要

坛紫菜是潮间带重要的经济藻种,对高温、渗透压等逆境具有独特的调控机制。本文采用基于高通量测序的数字基因表达谱(DGE)技术研究了坛紫菜在高温胁迫下的基因表达差异,并分析其相应的响应方式；利用实时定量PCR技术对DGE部分数据进行验证；检测了其中较有代表性的应答基因hsp70的差异表达。结果显示,高温胁迫下坛紫菜中有256个unigene上调表达,以HSP、核糖体蛋白L12、延伸因子EF-Tu 及部分光合作用相关基因为代表,3820个unigene下调表达,主要为核酸、蛋白以及糖类等合成代谢相关基因。Gene Ontology分析表明,差异表达基因主要定位于质体等有膜细胞器,参与繁殖和发育过程,行使催化和连接酶活性的功能。Pathway分析显示,这些基因分布于107条pathway中。其中,下调表达基因最显著富集于mRNA监督和RNA转运途径,而上调表达基因部分富集于内质网的蛋白加工、RNA降解及光合作用途径。验证表明此次DGE结果具有较高准确性,hsp70基因对高温响应积极。综上所述,DGE结果反应出,在高温胁迫时,坛紫菜出现基础代谢减慢、合成速度下降、能量合成受阻、碳同化降低等现象,但光合作用前期未受影响,同时补救途径启动。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	严小军	宁波大学海洋生物工程重点实验室应用海洋生物技术教育部重点实验室	235	1827	21.0	28.0
2	骆其君	宁波大学海洋生物工程重点实验室应用海洋生物技术教育部重点实验室	70	640	14.0	22.0
3	杨锐	宁波大学海洋生物工程重点实验室应用海洋生物技术教育部重点实验室	53	418	11.0	18.0
4	赖晓娟	宁波大学海洋生物工程重点实验室应用海洋生物技术教育部重点实验室	2	14	1.0	2.0