杜仲IPI基因全长cDNA克隆与生物信息学分析

• 作者: 刘攀峰 吴敏 杜红岩
• 来源期刊: 经济林研究
• 学科: 农学
• 关键词: 杜仲 IPI 基因序列 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 杜仲研究专栏
• 页码范围: 27-33
• 分类号: S603.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1003-8981.2014.01.005

摘要

为解析杜仲异戊烯基焦磷酸异构酶基因序列信息和深入研究基因功能,以杜仲叶片cDNA为模板,采用反转录RCR及RACE技术分离出杜仲IPI基因全长的cDNA克隆.测序及生物信息学分析结果得出基因序列全长l 231 bp,共编码306个氨基酸残基,细胞定位于叶绿体.推导蛋白相对分子质量34.65 kD,理论等电点(pI)5.40,为疏水混合型蛋白质,属Nudix水解酶蛋白家族,基序类型4种,含10个潜在功能位点,三级结构以单体形式存在,主要保守基序位于分子结构中部.系统进化分析推测杜仲IPI蛋白与欧洲榛IPI蛋白亲缘关系最为接近.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	杜红岩	中国林业科学研究院经济林研究开发中心	46	256	8.0	12.0
5	刘攀峰	中国林业科学研究院经济林研究开发中心	27	303	8.0	17.0
9	吴敏	中国林业科学研究院经济林研究开发中心	2	10	2.0	2.0