希金斯炭疽菌RGS蛋白生物信息学分析

• 作者: 韩长志
• 来源期刊: 生物技术
• 学科: 农学
• 关键词: 希金斯炭疽菌 G蛋白信号调控因子 信号肽 二级结构 亚细胞定位 生物信息学
• 年，卷（期）: 2014,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 36-41
• 页数: 6页
• 分类号: S436.35
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-311X.2014.01.0010

摘要

目的:由希金斯炭疽菌侵染菜心、萝卜等十字花科蔬菜引起的炭疽病,不仅降低了蔬菜的产量,还影响着蔬菜的品质.RGS作为植物病原菌G蛋白信号转导过程中的重要调节因子,在众多生理生化过程中发挥着重要作用.对希金斯炭疽菌中典型RGS进行明确以及生物信息学分析,为深入开展该菌RGS功能研究打下坚实的理论基础.方法:基于酿酒酵母中4个典型RGS序列,利用Blastp以及关键词对希金斯炭疽菌蛋白质数据库进行比对、搜索,以及通过SMART保守结构域分析,获得典型的RGS,并对上述RGS进行二级结构、疏水性、信号肽以及亚细胞定位等生物信息学分析.结果:希金斯炭疽菌中的RGS在蛋白质二级结构中均含有较高比例的α螺旋结构,均不含有典型的信号肽序列,均为亲水性蛋白;其中3个定位在细胞核中,其他2个则分别定位于高尔基体、线粒体上.结论:希金斯炭疽菌中有5个典型的RGS,在二级结构特征、亲水性方面一致,但其亚细胞定位位置不同.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	韩长志		74	325	9.0	16.0